答：这要看开具发票或者实际结算时是否变更了原合同，如果双方并没有变更原合同，则原合同价款计算缴纳印花税；如果双方按实际结算金额变更了原合同，扣除原合同已缴纳印花税的价款，就增加的部分进行补缴。

　　所以，贵公司不能就实际发票金额大于合同金额来确定，而是要看原合同是否就增加的金额修改了合同，如果修改了就应按修改后的合同进行补缴印花税。如果没有，则无须补缴印花税。

　　知识拓展：

　　《财税公告2022年22号 关于印花税若干事项政策执行口径的公告》 第三条、关于计税依据、补税和退税的具体情形

　　（一）同一应税合同、应税产权转移书据中涉及两方以上纳税人，且未列明纳税人各自涉及金额的，以纳税人平均分摊的应税凭证所列金额（不包括列明的增值税税款）确定计税依据。

　　（二）应税合同、应税产权转移书据所列的金额与实际结算金额不一致，不变更应税凭证所列金额的，以所列金额为计税依据；变更应税凭证所列金额的，以变更后的所列金额为计税依据。已缴纳印花税的应税凭证，变更后所列金额增加的，纳税人应当就增加部分的金额补缴印花税；变更后所列金额减少的，纳税人可以就减少部分的金额向税务机关申请退还或者抵缴印花税。

　　财务部  李亚晨（转载）